安徽巡抚王之春派出大批人马，两江总督刘坤山派出了三艘军舰，长江水师提督黄少春调来三营水师。
在敌人潮水般涌来时，他们开始向南陵方向退却。
自立军前军原打算退向南陵等待援军，哪知他们等待的援军根本不会来!
康有为虽说以支持起义名义，确实募得三十万巨款。但钱进他手后舍不得拿出，连他亲口答应的自立军的军响，都是一拖再拖，迟迟不能到位，使得起义时间一再推迟。
而前军未能接到通知，单独起义了，于是陷入了孤军作战的危险境地。
他们且战且退，在横港、杨家山、汀家洲、南陵，与清军激战。终因众寡悬殊，他们浴血奋战七昼夜后，全军覆没。
吴禄贞死里逃生。
吴禄贞就是这样踏上革命征途的，当时年仅二十岁，却表现出了大无畏的英雄气概。
对大通起义，他“常叹功败垂成，引为一生的憾恨。”起义虽说失败了，却使革命的营垒进一步觉醒，改良派进一步分化，人们也看清楚了某些人贪婪的嘴脸。
大通起义，对以后的革命运动有着深远的影响。
孙中山先生在《祭吴禄贞文》中所说的“倡义江淮，建牙大通。”就是指此而言。
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