名义上，根负责暗部忍者的培训工作，但实际上两者几乎是彼此独立的机构，职能相似，但却分别听命于根统领团藏和暗部统领。
这是特殊的历史、政治原因造成的，木叶本没有必要设置一个独立于暗部的所谓培训部门。
因此团藏被终身囚禁之后，不知火玄间一人独揽「根」和暗部，两个组织遂开始合并，组成新的暗部。
58年3月。
不知火玄间、惠比寿、阿凯三人小聚，在烤肉店吃喝。
吃饭时，不知火玄间问道“小寿，我之前听火影大人说，他想让你担任木叶丸的家庭教师，现在怎么样了？”
“是这样。”惠比寿点点，接着说道，“木叶丸那孩子有些太内向了，他的家人都希望他能更开朗一些，就找上我了。”
这个时空之中，木叶丸的父母都活得好好的，并没有战死。
在父母严格的家教之下，木叶丸性格十分老实甚至有些木讷，是典型的乖孩子、好学生，与原著记载中的顽皮截然不同。
阿凯喝了点酒，莫名地笑了两声“嘿嘿。”
“你笑什么？”
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